Vid fredagens möte med Financial Stability Oversight Council (FSOC), det sista under president Joe Bidens administration, sade Yellen att under Trumps första mandatperiod krympte panelens personal till ensiffriga tal och att infrastrukturen för samordning mellan olika myndigheter minskades avsevärt.
"Detta innebar att vi var mindre rustade för att identifiera och reagera på risker för det finansiella systemet", sa hon och tillade att den demokratiska Biden-administrationen återinvesterade i panelen, som skapades efter krisen 2007-2009 för att övervaka systemrisker.
"Detta förstärkta råd har levererat och bidragit till att göra vårt finansiella system mer motståndskraftigt och vår ekonomi starkare. Det är viktigt att det fortsätter att göra det till förmån för det amerikanska folket", sade hon i ett förskrivet anförande.
Trump har inte lagt fram någon vision för de finansiella tillsynsmyndigheterna, men han har lovat att skära ned på betungande regleringar.
Yellens kommentarer kom när FSOC varnade igen i sin årsrapport om potentiella risker som kommersiella fastigheter, privata krediter och kryptovalutor utgör, och uppmanade tillsynsmyndigheter och företag att vara vaksamma när det gäller att övervaka sårbarheter.
Medan 2024-rapporten upprepar risker som flaggats i tidigare rapporter, varnar den för att de har "utvecklats på följdriktiga sätt".
Gruppen menar att det finns tecken på ökande risker inom kommersiella fastigheter, särskilt inom kontorssektorn i stora stadsområden. Ökade vakanser i kontorslokaler, långsam hyrestillväxt och högre lånekostnader pressar låntagarna, vilket leder till högre förfallna lån och ökade avsättningskostnader för bankerna.
När det gäller kryptovalutor varnade gruppen för att stablecoins kan utgöra en risk för den finansiella stabiliteten och upprepade kraven på lagstiftning som skapar ett omfattande regelverk för den digitala valutaprodukten. Gruppen sa att de flesta andra kryptoföretag och emittenter antingen bryter mot befintliga finansiella regler eller verkar utanför deras gränser, vilket skapar ökade risker för "betydande bedrägeri och manipulation". Gruppen efterlyste lagstiftning som ger federala tillsynsmyndigheter uttrycklig befogenhet att polisera kryptomarknader på plats, liknande dess rekommendation 2023.
Gruppen varnade också för att även om det ännu inte har skett någon större cybersäkerhetsincident vid en stor finansiell institution, är frågan högst upp i tankarna för tillsynsmyndigheter och industri med cyberattacker som nästan har fördubblats sedan COVID-19-pandemin.