Transnet gjorde en förlust på 1,6 miljarder rand under samma period förra året.
Det skuldtyngda företaget har kämpat för att tillhandahålla adekvata godsjärnvägs- och hamntjänster i flera år på grund av brist på utrustning och eftersatt underhåll.
Den kroniska underpresteringen har hämmat exporten av viktiga råvaror som kol och järnmalm, vilket har hämmat den ekonomiska tillväxten i Afrikas mest industrialiserade nation.
Logistikföretaget uppgav att intäkterna ökade med 6% till 41,5 miljarder rand under de sex månaderna tack vare tariffhöjningar inom järnvägs-, hamn- och pipelineverksamheterna.
Högre löne-, säkerhets- och underhållskostnader drev dock upp kostnaderna med 10,2% till 27,9 miljarder rand.
(1 dollar = 18,7258 rand)