Konkurrensadvokaten Maria Luisa Stasi lämnade in ett ärende till Competition Appeal Tribunal på tisdagen och hävdade att brittiska företag och organisationer kollektivt kan vara skyldiga mer än 1 miljard pund (1,27 miljarder dollar) i kompensation.
"Enkelt uttryckt straffar Microsoft brittiska företag och organisationer för att de använder Google, Amazon och Alibaba för cloud computing genom att tvinga dem att betala mer pengar för Windows Server", sade hon.
"Genom att göra detta försöker Microsoft tvinga kunderna att använda sin molntjänst Azure och begränsa konkurrensen i sektorn."
Separat undersöker Storbritanniens konkurrensmyndighet cloud computing, en marknad som domineras av Amazons AWS, Microsofts Azure och, i mindre utsträckning, Google Cloud Platform.
Microsofts licenspraxis, t.ex. för Windows Server och Microsoft 365-produkterna, är en del av undersökningen.
En uppdatering av utredningen kommer att ske inom kort.
Microsoft införde 2020 nya licensavgifter för att köra sin programvara på stora molnleverantörer.
Enligt yrkandet använde Microsoft sedan avgifterna för att förmå kunder att använda Azure-plattformen.
Uppgifter från Competition and Markets Authority som publicerades i maj visade att Microsoft vann kunder i en betydligt högre takt än andra molnleverantörer sedan licensändringen.
USA:s Federal Trade Commission inledde förra veckan en bred antitrustutredning av Microsoft, inklusive dess molntjänstverksamhet, enligt en källa med insyn i ärendet.
FTC undersöker anklagelser om att mjukvarujätten potentiellt missbrukade sin marknadsmakt inom produktivitetsprogramvara genom att införa straffande licensvillkor för att förhindra kunder från att flytta från Azure till konkurrenskraftiga plattformar, sa källor förra månaden.
(1 dollar = 0,7891 pund)